Гастроентерологично отделение на МБАЛ "АВИС МЕДИКА" разполага с 10 легла. В него работят двама лекари със специалност вътрешни болести и гастроентерология. Работи се по договор с НЗОК по клинични пътеки, свързани със заболявания на хранопровода, стомаха, дванадесетопръстика, дебелото черво, черния дроб и жлъчните пътища и панкреаса. Ендоскопският сектор към отделението е снабден с последна генерация видеоендоскопска апаратура "Пентакс" с висока резолюция и възможност за документиране на резултатите от изследванията, както и извършваните диагностични и терапевтични манипулации. Ендоскопският сектор разполага с всичко необходимо за оперативна ендоскопия, прилагана основно при лечението на доброкачествените новообразувания на стомаха и дебелото черво. Секторът за Образна диагностика към Гастроентерологичното отделение е оборудван с висококачествена ехографска апаратура "Фукуда" с трандюсери за коремна ехография и повърхностни структури, които са с капацитет за изследване на магистрални и периферни кръвоносни съдове чрез триплекс Доплер.

 В този сектор се извършват тънкоиглени биопсии под ехографско наблюдение на подлежащи на уточняване промени в паренхимните коремни органи, както и терапевтични манипулации при лечение на чернодробни кисти от различен произход.